中巴经济走廊建设进入第二阶段后，中巴农业合作取得实质成果，多项中国先进农业科技在巴基斯坦得到推广。例如，越来越多巴基斯坦农民使用大豆-玉米间作技术，这项技术将帮助巴基斯坦减少豆油进口，节省宝贵的外汇储备；杂交小麦技术使得每英亩产量比普通小麦高出40%，可帮助巴基斯坦解决洪灾引发的粮食短缺问题，并将小麦出口恢复至历史较高水平。此外，中巴高校还联手开发高产杂交水稻品种，以促进巴基斯坦大米出口。