棉花是巴基斯坦主要的经济作物之一，也是主要的出口外汇资源。从巴基斯坦中央棉花委员会（PCCC）统计2018-2019巴基斯坦棉花出口情况统计可以看出，巴基斯坦2018-2019年度出口各国的棉花总量达11790吨。巴基斯坦的棉花主要出口至越南、印度尼西亚两国，占60%以上，泰国、孟加拉国和中国也是巴基斯坦棉花的主要出口国。
目前，巴基斯坦纺织业高度依赖进口棉花，需要更优质的棉花用于混纺和生产用于出口的优质纺织产品。巴基斯坦主要进口棉花为陆地棉、长绒棉和中短绒棉。巴基斯坦中央棉花委员会统计数据显示，巴棉花主要进口国包括美国（约占50%）、印度、阿富汗、埃及、巴西等。
中巴两国在棉花收集和鉴定方面的合作种质资源非常重要，目前，两国已经交换了300多个棉花种质资源。棉花种质资源是棉花基础研究和应用研究的物质基础，巴基斯坦的亚洲棉花与中国的陆地棉不同。就遗传特性而言中国棉花以其高产，优质和早熟而闻名，而巴基斯坦棉花以其抗热，抗旱，耐盐碱和棉花卷叶病毒闻名。中巴两国在棉花种质，资源的收集和鉴定方面的合作具有重大的意义和时机。
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